该成果建成唯一的国家棉花种质圃，宿生保存材料887份，包括野生资源698份，特色资源189份；突破了种间杂交不亲和的技术难关，获得种间杂种126个，其中栽培棉×野生棉91个，野生棉之×野生棉35个。收集保存资源所涵盖的棉种数和杂种数均居世界第一。对我国棉花濒危资源进行了抢救。收集或创新一批珍稀资源或优良亲本材料，其中，半配生殖是棉花独有的突变材料，阐明了高频率发生单倍体的细胞胚胎学原理。通过远缘杂交，培育了200余份来自于野生棉的新种质材料，直接用作育种的重点亲本47份，“中G5”等表现突出，具有非多毛抗棉蚜特性，并高抗黄萎病，纤维品质优良，打破了常规多毛抗蚜与产量、品质的负相关。
　　该成果在收集保存、创新研究中，形成了4项新技术：试管苗嫁接移植，不仅简单、成本低、成活率高，且有抢救污染苗、缩短周期和早期繁殖的明显特点；抗虫棉子叶期快速鉴定，效率提高20—100倍；异地枝条引种，解决了非种子异地引种问题；黏合剂自交，尤其适用于花粉管通道转化外源基因等规模化工作，效率提高3—4倍，成本降低3—4倍。创立了3个工作体系：自然突变材料自发有序的收集；多重保险的种质保存；非整倍体的宿生保存。在农杆菌介导Bt棉的研究中，发现了早代材料高度败育的细胞学原理。完成了18个棉种的核型研究、22个种间杂种的细胞学分析；在国内率先开展了棉花荧光原位杂交（FISH）研究，在技术途径上形成3点特色，取得6个突破性研究结果，结合细胞学等研究结果，在棉花生物学基本理论上提出了一些新论点。筛选到7个与抗黄萎病、纤维品质和产量性状的SSR分子标记，定位了QTL，并获2项专利。