记者4日从中国农业科学院获悉，该院深圳农业基因组研究所（岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心）王桂荣研究员课题组联合崔鹏研究员课题组成功构建“果蔬杀手”橘小实蝇最完整基因组图谱，3日发表于国际期刊《自然·通讯》。

因其食性杂、寄主广、繁殖力强，橘小实蝇被称为果蔬界的“头号杀手”。高质量的基因组图谱，为开发新的害虫绿色防治手段、靶标的精准发现与定位提供了重要资源。

近年来，研究人员陆续发布了多个橘小实蝇基因组版本，然而，这些基因组大多基于混合个体组装，尤其是在橘小实蝇中心粒（细胞分裂和环境适应的关键结构）、性染色体这些富含重复的基因序列区域有较多的“盲区”。

橘小实蝇

论文共同通讯作者王桂荣表示，研究团队综合利用多种三代测序技术，以单个体雄虫的测序数据作为基本骨架，整合群体数据，成功组装出了大小近600Mb的基因组。

橘小实蝇端粒到端粒参考基因组

与其他橘小实蝇基因组参考版本相比，新的基因组图谱首次实现了从端粒到端粒的无缺口完整覆盖，填补了以往基因组中高度重复的复杂区域留下的空白。“比如，新的基因组图谱覆盖了染色体末端的端粒结构和在细胞分裂中起关键作用的着丝粒区域，还包含了大量重复序列的Y染色体全序列。这些新序列可以识别出多个以往未发现的串联重复基因簇，尤其是气味受体基因家族，这些结构在橘小实蝇的寄主识别和环境适应中可能发挥着重要作用。”王桂荣说。

“研究在此基础上进一步解析了橘小实蝇中心粒，性染色体等高重复结构区域，挖掘出了Y染色体特异性基因和气味受体等潜在的绿色防控技术靶标，为害虫绿色防控技术的研发与优化提供了高质量参考基因组资源。”论文共同通讯作者崔鹏表示。

（中国农业科学院深圳农业基因组研究所供图）