沼气发酵功能微生物是沼气发酵的核心，其数量的多寡和活性的强弱直接决定沼气发酵的效率。产甲烷古菌是原料代谢过程中最末端的功能微生物，也是众多沼气发酵功能微生物中最关键的一类，我们可以通过观察产甲烷古菌的生长而对沼气发酵体系的运行状况作出初步诊断。

　　产甲烷古菌具有独特的辅酶F420，可以在波长420nm的紫外光照射下发出蓝绿色的荧光，由此区分产甲烷古菌和非产甲烷古菌。荧光显微镜可以帮助我们直观地观察发酵体系中产甲烷古菌的生长状况。