近日，中国农业科学院作物科学研究所水稻优异种质资源创新利用创新团队首次组装了普通野生稻单倍型无间隙染色体基因组，构建了野生稻种质资源优异基因发掘利用与种质创新的平台，并鉴定了关键的耐盐与抗稻瘟病基因。相关研究成果发表在《自然通讯（Nature Communications）》上。

栽培稻是由二倍体普通野生稻驯化而来，在其驯化过程中野生稻所携带的大量优异性状等位基因丢失或者被削弱。但野生稻杂合度高导致基因组组装困难，且大量的优异抗性基因与不利性状连锁，导致育种中难以直接利用。

该研究团队以综合抗性优良的中国普通野生稻“Y476”为载体，首次组装了单倍型无间隙染色体基因组，并以此为基础，分别以籼稻“9311”和粳稻“日本晴”为受体亲本，构建了两套覆盖全基因组的染色体片段置换系，建立一个能够高通量鉴定发掘野生稻优异基因的平台。同时利用该平台鉴定出一个耐盐相关基因与一个抗稻瘟病基因。该研究为野生稻基因挖掘提供了高效平台，为稻种资源利用与品种遗传改良提供了先进工具。

该研究得到了国家重点研发计划等项目的支持。（通讯员 田浩园）

原文链接：https://www.nature.com/articles/s41467-024-48845-6