近年来,《作物学报》的学术影响力在稳步提高,在中文版中国科技期刊和农业科技期刊中均保持领先位置。2012年12月被中国科技信息研究所评为“2011年百种中国杰出学术期刊”,这是《作物学报》第11次蝉联这一称号。据中国科学技术信息所的统计,《作物学报》在2012年版《中国科技期刊引证报告-核心版》中的总被引频次为5508,影响因子为1.559,比上年的5093和1.431分别增加了7.5%和8.9%。“综合评价总”分达97.4分,继续位列中国科技核心期刊的第3名。
“百种中国杰出学术期刊”是中国科学技术信息研究所每年根据中国科技论文与引文数据库(CSTPCD)统计结果,经过分析、评价,采用文献计量学指标评选出的中国100种最具学术影响力的学术期刊。