近日，中国农业科学院深圳农业基因组研究所（岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心）研究员刘永鑫团队系统总结了在植物微生物组研究中宿主DNA去除技术的最新进展，提出了两种具有潜力的宿主DNA去除新方法，为植物微生物组研究提供参考。相关综述文章发表在《植物生物技术杂志》（Plant Biotechnology Journal）上。
在植物微生物组研究中，宿主DNA的高比例污染一直是制约宏基因组分析精度的核心瓶颈。为解决这一问题，研究人员研发出了多种宿主DNA去除技术，如物理分离、选择性裂解、酶解处理、磁珠靶向序列捕获等。尽管这些方法在减少宿主序列干扰方面取得了一定进展，但在效率、特异性和适用性方面仍存在局限。
该团队长期从事宏基因组方法开发，此篇论文系统评述了不同宿主DNA去除技术的优势与局限，因技术效率与特异性不足导致微生物群落解析精度受限，影响功能机制挖掘与应用转化。
在此基础上，通过整合物理分离、CRISPR-Cas靶向切割、染色质免疫沉淀等前沿方法，该团队构建了覆盖实验操作与计算分析的标准化技术路径，确保微生物DNA富集流程的高效性与可重复性。
该研究为突破植物微生物组研究中的宿主干扰难题提供了系统性解决方案，对促进微生物肥料、生防制剂及合成群落的研发应用具有重要指导意义。
该研究得到国家自然科学基金、中国农业科学院科技创新工程项目的支持。
相关论文信息：https://doi.org/10.1111/pbi.70379
