在水稻、玉米、小麦、大豆、油菜、棉花等主要农作物上获得功能分子标记1029个，定位和标记重要性状基因/QTL 142个；申报发明专利14项，获得发明专利授权18项，制定技术标准2项，提升了作物分子育种技术水平；创制优异新种质、新材料598份，材料积累成效突出；审定新品种77个；申请植物新品种保护权40件，获得新品种保护权31件，审定新品种推广面积超过11556万亩；获得省部级成果奖励7项，成果转让4项。
    这是863计划现代农业技术领域“作物分子育种与品种创制”在2015年度所取得的部分成绩。
    该项目首席专家中国农业科学院副院长、中国工程院院士万建民说， 2015年，该项目根据国际种业技术发展趋势，重点对制约我国作物育种的前沿技术和关键技术开展深入研究，项目在作物分子育种技术创新、新材料与新品种选育、专利和新品种权申请，以及品种推广应用方面取得了良好进展，完成了项目计划任务指标。同时，项目组发表研究论文146篇，其中SCI收录论文66篇，培养研究生79名，其中博士生34名，强化了分子育种基础理论研究和人才队伍建设；示范线与产业化基地57个，共有43家企业参与项目实施。
    研究人员利用联合定位的方法定位叶片卷曲度（LRI）相关QTL位点并挖掘有利等位基因；利用黄华占背景导入系挖掘广谱抗性新基因Xa39[p1]并验证其功能，开发分子标记；在水稻微管蛋白调控生长发育研究方面，研究人员为进一步阐明微丝与植物发育的机制研究奠定了基础，对水稻形态改良提供理论支持；在水稻垩白突变体基因的精细定位与候选基因分析方面，利用垩白突变体eb5与籼稻品种南京11杂交构建作图群体。
    同时，万建民建议，加大功能标记基因的开发和应用力度，加强新种质和选育品种的应用及推广，增加经费管理的灵活性；在项目组织管理方面，要充分发挥项目专家组和课题承担单位的作用，强化与企业合作，注重统筹协调和运行管理。下一步将进一步强化项目内科技资源共享以及协作交流；同时注重与企业合作，加快成果转化，强化我国种子企业育种技术创新和产业化能力，以支撑我国作物种业快速发展。